Вы используете устаревший браузер. Этот и другие сайты могут отображаться в нем неправильно. Необходимо обновить браузер или попробовать использовать другой.
Вообще он выводится в \includes\OutputPage.php
Странно что нет настройки для его отключения, хотя смысла в этом особо нет, у вас есть Special:Version где можно посмотреть версию. И еще много косвенных признаков по которым можно определить что установлено.
Эта возможность, в силу принципов разработки Mediawiki, совсем не предусматривается. Поэтому вам придется делать это только вручную, внося правки в код самой Mediawiki.
Очевидно, что при обновлении вики-движка ваши изменения пропадут.
Хотя, в случае если у вас своя тема, вы можете регулярками вырезать ненужный вам метатег прямо в своем скине. Тогда движек можно будет обновлять, не опасаясь потерять правки.